Los científicos evolucionistas hacen uso de la selección natural y la adaptación para explicar cualquier aspecto de la biología, ecología y comportamiento de los organismos vivientes y de los pasados. esto queda evidente cuando uno lee la literatura científica popular y escucha las explicaciones en los documentales de la televisión. Un análisis detallado de las prácticas comunes entre los científicos evolucionistas nos indica que siguen las siguientes pautas:

1. Se fragmenta el organismo en “rasgos” distintos o estructuras individualmente optimizadas para la selección natural.
2. Cuando se ve que la optimización de esos rasgos separados no funciona para explicar su origen se admite que un rasgo no puede variar demasiado sin repercutir en el resto del organismo.
3. Cuando una parte no resulta óptima, se interpreta como la mejor adaptación posible dadas las circunstancias y teniendo en cuenta todos los factores. En otras palabras, se admite que el mundo no es perfecto, pero es el mejor que se podría obtener por medio de los mecanismos de la evolución al azar (mutación y selección natural).

¿Cuáles son los problemas con este razonamiento?

1. Se toma el organismo como una colección de rasgos aislados. Pero el organismo no se puede atomizar en partes independientes cuyo origen y funcionamiento se pueda explicar aparte del conjunto.
2. Se consideran solo unos pocos rasgos
3. Se utiliza la técnica de todo vale (si un argumento adaptativo fracasa, ¡prueba otro!). Esto es una falacia.
4. No se admite que los postulados o presuposiciones puedan ser falsos, sino que se invoca la ignorancia (“no sabemos lo suficiente”, “hay que investigar más”, etc.).
5. Se insiste en la utilidad inmediata del rasgo u órgano o en aquella que más aparente resulta a los ojos del observador, sin profundizar en los detalles o en las interrelaciones desconocidas del órgano.
6. No existen estimaciones de adaptación a lo largo de toda la vida de un organismo o de una población. Por otro lado, ¿cómo se mide la adaptación?

En la práctica, el modelo evolucionista basado en mutaciones, selección natural y adaptación tiene poca solidez y no sirve para explicar la historia de la vida en la tierra. La selección natural podría explicar como mucho la variación a nivel de especie o género, pero no la aparición de nuevas formas de organismos que implican nuevas estructuras o nueva información.